تتم إدارة العمل في مديرية صحة الكرك من خلال الاقسام والوحدات التالية :
1.قسم شؤون الموظفين
2. قسم التأمين الصحي
3 - قسم المالية
4- قسم تكنولوجيا المعلومات
5- قسم الرقابة على الأمراض
6 - قسم صحة المرأة والطفل
7- قسم صحة البيئة والغذاء
8 - قسم الصحة السنية
9 - قسم الأمراض الصدرية وصحة الوافدين
10 - قسم الصحة المدرسية
11 - قسم التمريض
12- قسم المشتريات والتزويد
13- قسم الخدمات الفندقية
14 - قسم الأبنية والصيانة
15- قسم النقل
والوحدات التاليه:
1 - وحدة الجودة
2 - وحدة الديوان
3 - وحد الرقابة على المهن والمؤسسات
4 - وحدة المتابعة والإشراف